De l’agriculture au génie industriel, en passant par la santé et les métiers des services aux entreprises, c’est plus d’une vingtaine de filières qui sont recensées dans le Guide de l’Enseignement Supérieur.
L’agglomération chalonnaise est devenue attractive au plan national, grâce au développement de la filière Image et Son, qui permet aux acteurs de se fédérer autour de projets importants. L’Institut Image (Arts et Métiers ParisTech), l’IUT de Chalon, Nicéphore Cité, le Lycée Niepce, EMA Fructidor et le Conservatoire à Rayonnement Régional ont créé des coopérations renforcées sur des projets de formations. C’est le cas de la classe préparatoire PTSI, spécialité Métiers du Son. (Lycée Niepce et Conservatoire à Rayonnement Régional) ou encore la Licence professionnelle Techniques et Activités de l’Image et du Son dispensée à l’IUT de Chalon.
Les formations scientifiques et techniques rassemblent de nombreux étudiants et apprentis post-bac sur le territoire, dans des secteurs comme le génie industriel, le génie des matériaux, la chimie et l’informatique, notamment.
Dans le domaine de l’Agriculture et d’un développement soutenable, les établissements du Grand Chalon forment non seulement les gestionnaires d’exploitation agricole comme au Lycée de Fontaines, mais ouvrent aussi à d’autres métiers liés à ce secteur, comme celui des éco-énergies.

Le secteur de la Santé et du Social a aussi une place importante dans le paysage grand chalonnais, qui accueille l’Institut de Formation en soins Infirmiers de Chalon-sur-Saône, le BTS Services et Prestations des Secteurs du Sanitaire et du Social et la préparation aux concours d’entrée dans les écoles paramédicale et sociales.

L’Université de Bourgogne est représentée sur le territoire par l’IUT de Chalon-sur-Saône, mais aussi par l’IUFM qui dispense à présent deux Masters, le Master « Métiers de l’Enseignement et de la Formation – Professeur documentaliste » et le Master « Métiers de l’Enseignement et de la Formation – Technologie ».

La Logistique et le Transport sont des domaines d’excellence à Chalon, depuis la création de l’IUT, grâce au DUT et à la Licence professionnelle. La filière a été renforcée en 2010 par le CNAM de Bourgogne qui a ouvert une formation en Ingénierie Supérieure de la Navigation Intérieure, autrement dit, une école de la navigation fluviale.

Enfin le Commerce et le Marketing attirent de nombreux étudiants et apprentis de la région, tout comme les Services (Immobilier, Assurances, Comptabilité, Gestion, Finances), ces cursus aux nombreux stages permettent d’établir de véritables relations avec le monde de l’entreprise.